对于中小企业而言，很多在上行政管理系统之前没有任何其它的管理软件，如果简单照搬大型企业的模式，同时上行政管理系统软件和多套企业管理软件，必然造成“消化不良”而导致失败。那么行政管理系统如何集成其他系统功能？
这种情况一般适合同时存在多个管理软件的企业，如：企业同时存在行政管理系统、ERP、CRM、HR，以及通过定制开发构建的各种管理系统，这些系统可能是在不同时期引入和构建的，一般都来源于不同的软件提供商。但随着应用的深入，多系统之间的数据不统一，数据之间缺乏关联性，多系统之间的数据重复维护管理等，成了企业信息化新的困扰。
此时一般以行政管理系统软件为基础平台，集成和整合相关的功能和应用，实现多系统之间的数据交换和传输，以及解决多系统之间数据的统一性和关联性，大大提升了企业信息化的效果。典型的如：行政管理系统与ERP的集成、行政管理系统与CRM（客户关系管理）系统的集成等。
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