1、资金不足和计算机人才匮乏
企业信息化是一个长期的过程，也是一个逐步深入和逐步完善的过程。在中小企业当中，绝大多数的员工只能用计算机进行一般的操作应用，既懂IT技术又懂业务的信息化类人才非常少。企业缺少懂合同管理系统信息化的人，制约了企业信息化的普及和深入，影响信息化的效果。
实力弱、资金不足，也是一个重要因素，目前市场上提供的个性化解决方案相对来说比较高，很多中小企业难以接受。同时，中小企业自身很少有主动去根据自身的要求建立一个新的信息化应用，很多时候上合同管理系统系统都是在行业之间的相互推动，在考虑成本的情况下采用行业通用的解决方案，但是没有结合自身需求就不能很好的发挥自身的优势。
2、合同管理系统厂商服务不足，合同管理系统应用的效果差
从服务市场看，中小企业合同管理系统信息化服务或者说效益上不去、企业合同管理系统信息化积极性不高的原因与合同管理系统厂商有着一定关系。中小企业合同管理系统信息化服务的不成熟不规范，目前市场上有着众多的合同管理系统软件厂商，合同管理系统产品的同质化现象比较严重，通用性的产品多，能够做到量身定制的合同管理系统产品和服务比较少。
合同管理系统行业的严重同质化、服务能力的严重不足，很多合同管理系统厂商的产品没有技术含量，整个合同管理系统市场鱼目混珠，产品和服务水平相差很大，价格战越来越突出。同质化恶性竞争的后果，无形当中许多厂商降低了自己的服务质量，有一半以上的中小企业合同管理系统用户对服务不满意，合同管理系统厂商在为中小企业提供服务的时候，承诺没有达到，承诺很难，刚开始的承诺到最后实施的时候是两回事，大家只能把售后的服务降低，这是迫于无奈的事情。
3、 对信息化的认识不足
从众多的信息化案例中可以得出结论，企业信息化的效果和主要负责人有着直接的关系。很多中小企业负责人由于受本身素质与文化水平的限制，对合同管理系统信息化的认识不足，需要更多、更好、更久的培训、支持与服务。特别是企业的核心管理人员对信息化的意思淡漠，没有认识到信息化对企业带来的作用，在信息化过程中考虑不充分，缺乏整体的规划，头疼医头、脚疼医脚。很多企业的合同管理系统信息化只是单纯的依赖于软件厂商，甚至是被厂商牵着鼻子走，这种偏离轨道和不符合自身需要的信息化，其效果也可想而知。
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