合同管理系统的实施是一个系统工程，需要整体规划，分步来实施，关键是企业需要把目前最迫切，最关键，见效最快的需求先提炼出来，在此基础上逐渐加深应用，然后在扩展新的需求。合同管理系统软件的使用也是一个长期的过程，只有在实际应用过程中结合自身的需要，不断的完善和深化应用才能取得良好的效果。
以企业用户为例，信息化是企业的重要大事不能单纯的依赖软件厂商，企业自身的经验和水平对此起着决定性的作用，推广和实施合同管理系统，根本目的不仅是帮助企业建立一套完整的信息化管理系统，更重要的是透过先进的管理思想和方法实现管理的提升、业务的改善，促进企业制度与文化、人与组织的和谐发展。这就决定了企业在合同管理系统或合同管理系统的选型过程中必须立足企业的实际需求，转变以往的思维方式和观点，从合同管理系统真正在企业信息化过程中发挥的重要作用出发，从企业战略出发，选择企业所需要的合同管理系统系统。
企业的思想应该是与时俱进的，企业的格局和发展不是一成不变的，企业规模的变化或者发展方向和业务重点的改变，都可能导致现有的合同管理系统软件不适用于企业当前的发展需求，新出现的实际问题对合同管理系统系统有着新的功能要求。面对这样的情况，需要在原有系统进行二次开发和功能扩张。在此需要对合同管理系统用户特别强调的是，平台型合同管理系统在二次开发这方面，相对于产品型合同管理系统和项目型有更大的优势。
优秀的合同管理系统办公平台不仅能够满足用户当前办公的需要，同时也可以快速的满足用户后续新的应用需求，同时系统易于维护和管理，通过基础的软件平台统一了合同管理系统软件的接口和规范，有利于系统的实施、开发、维护和升级，降低了系统维护和服务技术难度、节省时间和成本。做好合同管理系统软件服务需要做到同时保障服务的质量和服务的效率、降低服务的成本，合同管理系统系统的后续服务是保障合同管理系统系统深入和持久应用的根本保障。
合同管理系统软件的应用伴随着用户单位管理的各个环节，需要结合自身的需要深入应用，它是一个系统和长期的过程。在合同管理系统的实施和使用过程中，可以由点到面、由浅入深、由简到繁的逐步展开，实现“全员化”、跨部门和跨地域的协同办公效果。买软件就是买服务，要想取得良好的使用效果，后期用户和软件厂商的合作，特别是软件厂商的服务起也是非常关键的。
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