不过，这种基于云的现成合同管理系统软件解决方案的民主化，它的另一面是，在谈及根据自身实际需求定制解决方案时，企业必须权衡一定程度的灵活性。在SaaS合同管理系统之前，公司采用的其中一个传统方法是购买现成的本地解决方案，然后外包给承包商定制及实现。另一种方法是在公司内部构建你所需的合同管理系统，这对预算较高的大公司来说完全负担得起。
这两种方法使企业能够对IT解决方案进行更高程度的定制，但都存在令人头痛的问题，包括营运费用的维护，以及他们雄心勃勃的项目随着推断的投资回报率一起蒸发成雾件的风险。
标准化的现成合同管理系统软件不能永远支持不断迭代变化的需求（如业务扩展或趋势改变）或长期的业务运作。因此，如果SaaS合同管理系统是软件交付的最佳可用模式，那么我们最好仔细研究定制和配置的复杂性和颗粒度，SaaS合同管理系统定制化比你想象的更重要。
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