1.管控到位
医院对科室绩效工资总额的一次分配通常都是控制到位的，但是，科室绩效工资的二次分配，往往都没有太好的办法。因为，没有医院绩效管理系统的支持，医院不掌握每一位医护人员的医疗任务完成情况，而要把绩效工资直接核算到职工个人，是不现实的。大多数医院一般仅提出科室绩效工资二次分配的原则和指导方案，科室具体是如何执行的，基本就处于一种失控状态。医院一旦采用绩效管理系统来核算职工绩效工资，就能规范科室绩效工资二次分配过程，从而确保绩效工资分配过程中的公平性、公平性，做到管控到位。
2.管理精细化
“细节决定成败”。医院绩效管理系统的一大功能便是采集HIS系统、PACS系统、LIS系统等中的有关数据，并对这些数据进行分类、归集、汇总、复合计算等。通过医院绩效管理系统，我们可以把每一位医护人员的工作责任具体化、明确化，实时采集他们的工作情况，并对他们的工作成果进行评价，发现问题及时纠正，及时处理。绩效管理系统的应用使得医院实现管理精细化成为可能。
3.管理精准化
绩效管理系统的使用，使得医院职工绩效工资的核算工作实现了一个质的飞跃。在医院采用绩效管理系统之前，科主任或护士长往往都没有工作量、工作质量等有关绩效考核的直接数据，通常都是参照职称高低来分配的。有了医院绩效管理系统，我们就可以看到，每一位职工的绩效工资是如何算出来的，职工所获得每一元绩效工资都跟他或她的哪些工作表现有关。医院绩效管理系统所能做到的管理精准化，常常为医院领导、科主任、甚至普通职工都大为赞叹。
4.绩效沟通高效
医院传统的绩效沟通都是采取会议、下发文件、面谈等方式进行，科主任、护士长时常抱怨费时、费力、还经常产生矛盾、有时还会影响到医护人员工作情绪、给医疗工作带来隐患。医院有了绩效管理系统，绩效沟通问题迎刃而解，绩效沟通效率、效果都大大提高。在医院绩效管理系统的支持下，科主任、护士长可以随时查询科室绩效考核结果、科室绩效工资分配结果、科室业务数据；普通职工都可以随时查询个人绩效考核结果、个人绩效工资分配结果、个人业务数据。
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