考勤系统可以详细记录各科室员工工作情况，全面支持奖金计算，绩效考核，全成本核算等，适应各医院建设数字化医院的新需求。 目前前，大多数医院使用的考勤软件是买考勤机时厂商送的免费软件，这些软件有很大的局限性。 首先，此类考勤软件大都非常简单，无法解决住院科室的考勤与排班相结合的问题。软件往往事先设置好了班组、班次，适合班次简单且固定的工厂企业使用，医院的行政、门诊科室尚能使用；如果员工的考勤班次每天都在更换，且没有规律性，比如医院的住院科室，用这些软件排班，设置起来就会非常麻烦，甚至每人每天的排班都需要手工录入，工作量非常大。
其次，此类考勤软件无法为收入、成本核算等深层次问题提供信息支撑。普通考勤软件虽然能从考勤机中取得所有人员的考勤数据，但因医护人员调科频繁，所以基本无法确定人员在各个科室的工作量和工作时间。这样一来，在划分科室收入、核算科室成本时，往往无从下手，容易造成收入分配不均、成本核算不准，科室间怨声载道。
普通考勤软件的典型特征是：软件不能自动生成值班表，班次需手工输入，工作量大；考勤结果不能和各科室值班表结合，不是根据上班情况考勤，而是根据设定的班次，抓取考勤记录比对，产生考勤结果，只能统计简单的考勤项目如迟到、早退等。
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