中小型企业与大型企业不同，在中国的市场上，具有灵活性往往伴随着很多瓶颈，在实施进销存软件时会受到多方面因素的影响。资金，人才，时间，以及更多的因素在制约着中小企业信息化。
中小型企业预算低、利润少、对于亏损与盈利的敏感程度远大于大企业，而目前国内进销存软件市场上比较成熟的主要还是高端产品，这些产品高昂的初始投入成本费用以及后继的二次开发、运行中的系统维护、更新和管理费用，令许多中小型企业望而却步。不过随着进销存软件研发商的不断出现和技术的逐渐成熟，现在的进销存软件价格相对来说比较合理了，进销存软件以最具性价比优势的SaaS模式构建，用户无需花高额的服务器架设费用和专业的IT维护人员，只需花很少的投入即可享用高质的进销存软件的使用，且功能齐全，更新维护方便及时，只要有网络的地方就可以使用，信息实时共享。所以在要求不是特别高，或者使用不是非常特殊的情况下，这个是比较合理的产品。
人才方面，实施进销存软件一方面需要具备掌握一定计算机知识、熟练运用进销存软件的人才，来保证系统的正常运行；另一方面需要有兼具计算机技术知识和企业管理知识的复合型人才，对系统进行管理、维护和二次开发，而中小型企业员工的素质普遍偏低，缺乏这两类、尤其是第二类人才。幸好现在的进销存软件做得都比较简单，很多复杂的财务过程都基本被简化为简单的操作，即时是很普通的人员，也比较容易上手。
时间方面，进销存软件的实施周期对于管理思路经常发生变化的中小型企业而言是非常不利的，甚至导致最终建成的进销存软件不能适应企业发展的需要，与企业管理者的预期结果往往相差甚远。如果购买进销存软件前没有试用过、或者没有了解过，那可能会麻烦一些。如果是一般的进销存财务管理、出入库管理、欠款管理，稍微有一定的常识，进销存软件实施起来也就半天时间，甚至更快，除非使用几十个站点，实施起来需要一定的时间。
总体说来，中小企业更注重短期的利益，重视的是看得见的回报，中小企业根据自身的管理需求，需找合适的进销存软件，这也就是中小企业最终体现的信息化建设之所在。
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