1、优化阶段
工程管理系统入稳定运行阶段后，系统的设计方面多少会存在一些操作不便或未能实现的功能。需要对系统进行优化处理，使系统完全符合蓝图设计要求。对于大型企业来说，这一阶段的时间长短取决于系统实施的质量和系统优化设计的能力，如果企业有自己的开发实施团队，这一过程可能会短一些。
2、扩充阶段
工程管理系统上线设计的功能经过一段时问的优化，已经完全满足了蓝图设计的需求。管理层在系统前两个阶段的运行中，已经慢慢体会到工程管理系统在工程项目等管理中所起的重要作用。希望在更多的领域应用工程管理系统达到优化企业资源的目的，这时开始提出新的管理需求，对工程管理系统功能进行扩充，这个过程是持续不断的，它会随着企业管理的不断提升，一直延续下去，直到工程管理系统生命周期结束。
3、保障阶段
工程管理系统上线初期，主要任务是保障系统的稳定运行，解决系统BUG、操作类错误、权限控制等。当系统顺利经过多个月结和一个年结的考验后。系统设计中存在的错误和用户的操作错误问题已经越来越少，处于稳定运行阶段，对于大型企业而言这个阶段一般要经历3～6个月的时间。
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