使用无纸化办公系统目的就是为了能够实现员工的搜索、共享，从而提高工作效率。所以，无纸化办公系统的操作应该是简单明了，不需要员工接受一系列的培训就可以上手使用的。 另外，无纸化办公系统的的访问权限也是需要重视的，所以要求所选择的无纸化办公系统可以由企业自行设置阅读、访问权限。这样的无纸化办公系统不仅可以确保文件被有序管理，也可以防止机密文件的泄漏，给企业造成一定的经济损失。
选择的无纸化办公系统安全性是最重要的，可以说保存的安全性始终是企业的首要任务，如前所述，对信息的访问可以限制在需要它的人身上，并且数据不会被意外或恶意地丢失。在无纸化办公系统中，有关谁可以访问什么内容和何时访问的完整信息，可以在需要解决的任何问题时留下可以遵循跟踪的痕迹。企业在发展过程中，不可能只使用一种办公系统。所以所选择的无纸化办公系统确保与使用的所有其他软件兼容，共同为企业的发展奉献力量。
企业在推进无纸化办公系统，能够有效降低企业人力资源的开支。很多企业都会在各个部门配置复印室，而实现无纸化办公之后，电子文件的处理上就能有效节约大量的人力与空间。在无纸化办公系统中，由于无纸化办公替代纸质文件，在一定程度上降低了企业的办公耗材费用，为企业的发展节约了成本，而且还降低了耗材的消耗。
同时，无纸化办公系统的建设符合我国提倡的低碳发展战略，有效减少办公过程中污染物的产生与排放。其中，无纸化办公系统的建设是实现低碳办公的最佳有效途径，在具体办公过程中不仅有效节约了纸张制造的原材料，无纸化办公系统的使用还避免了因造纸过程中对环境所产生的污染。此外，在纸质文件的打印过程中，所用到的碳粉或油墨等材料也会对环境造成一定的污染。因此，在企业中推进无纸化办公系统的建设，实现了节能低碳与保护环境的效果，也节约了人工和材料成本，一举两得，实现双赢。
