医疗行业OA系统的核心问题是如何提高日常的办公效率问题。因此我们日常工作的所有内容都可以归入OA处理的范畴，如文字处理、文件誊写、传真、申请审批、办公用品、公文管理、会议管理、资料管理、档案管理、客户管理、订货销售、库存管理、生产计划、器材需求、技术管理、质量管理、成本、财务计算、劳资、人事管理等等，那么这些都是办公软件的处理范围。
但是我们发现OA系统承载过多，那到底办公自动化应该包含那些内容：广义讲，对于提高我们日常工作效率的软硬件系统，包括打印机、复印机以及办公软件都是可以成为办公自动化系统。狭义上讲，办公自动化系统是处理公司内部的事务性处理，辅助管理，提高办公效率和管理手段的系统。
医疗行业OA系统能够为医疗单位管理人员、工作人员提供良好的办公手段和环境，使之准确、高效、愉快的工作。帮助实现信息资源的共享；增强员工协同工作的能力；强化领导的监控管理；有效管理起有形（设备等）、无形(业务信息、知识)资产，避免流失；实现公文流转、审核、签批等行政事务的自动处理，促进管理电子化、规范化，完美整合了组织内部的信息流。
通过OA系统办公平台使办公用品、图书管理、车辆管理等管理组织的有形资产避免流失；员工的工作经验和技术技能，不断积累，将成为组织中强大的共享资源，通过对知识资源的授权利用将加速创新和提高效率，也避免因人员流动导致工作的脱节与贻误，初步实现对组织无形(业务信息、知识)资产的管理，为公司进一步进行知识管理打好良好的基础。提高团队工作效率，加强协作精神，协同办公平台的无处不在，工作流、日程、即时沟通等功能，极大的提高组织的协同效率与沟通能力，使组织成为一个快速响应的整体，提高了公司的凝聚力，增强了公司的竞争力。
随着企业对"系统"理解的进一步加深，越来越多的企业已经把办公自动化提到日程上来，很多企业都在不同的层次上实现了办公自动化。事实上，有一些企业已成功地实施MRP或ERP系统，他们在生产、经营数据的收集、分析、处理方面已实现了自动化。但是，一般的MRP或ERP系统并没有在办公、行政事务方面，提供计算机处理功能，这方面的工作，只能依旧利用手工进行。不能全面实施系统，工作、生产效率难以得到进一步提高。 因此，通过系统的实施，对于企业提高运作效率与快速反应能力，加强企业的制度化、规范化管理，增强企业的市场竞争能力具有重要的意义。
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