这种考勤方式存在先天的弊端，方式繁琐，准确性、透明性、实时性差等，受人为因素影响大，甚至出现监管人员因个人因素导致考勤情况存在不平等现象，造成企业员工存在侥幸心理或代考勤情况的出现，不利于企业员工的管理。且由于人工考勤的方式，需要增加纸张与人工的成本，一定程度上增加了企业的运行成本。伴随着日益发展扩大的企业，人工考勤的弊端日益显现，企业的运行效率与效益都会受到很大的影响。
在21世纪的今天，随着信息化技术的发展，信息化社会正逐渐形成，越来越多的应用于实际生活中，信息化技术的革命也促进了社会各个方面的进步。这也要求企业进行转变，而利用信息化技术管理企业就成为企业在实际竞争中的当务之急，在经过摸索和实践之后，信息技术在企业中的充分应用，可以很好的改善这一窘境。企业规模的扩大，员工数量的增多，使得传统人工纸质的考勤方式不再能适应日益繁杂的企业考勤管理工作，这也从另一方面显示着信息化的考勤管理系统出现的必然性，与此同时，计算机技术的发展与普及，也变相的为考勤管理系统的发展打下良好的基础。
随着互联网的发展，很多年轻的中小型企业开始选择引入办公管理软件，以提高公司的管理效益和降低人力支出成本；而考勤管理正是其中的一环，以往的考勤管理解决法案基本上有2 种，1种是打卡，2是指纹打卡，第一种几乎是出于淘汰状况，毕竟太古老了，而且会存在各种代打卡的情况出现，也会在上下班的时候造成人员拥堵，所以必然被淘汰！；第二种是现在的主流模式，但是指纹打卡虽然确保打卡的真实有效，但是也会在上下班的时候造成拥堵，而且主要问题在于统计烦琐，每月更换卡片，机械故障率较高（插卡口易受破坏）；同时指纹打卡也涉及到指纹安全问题，一但指纹外协，产生的犯罪率也会有影响，因此综合前两者来看，企业考勤管理系统似乎是必须要有所改变！
移动办公软件也就应运而生，移动办公软件的产生完全解决了考勤管理上的难题，虽然考勤系统更方便简单，只需要在公司的范围内，均可在手机上完成考勤管理，这样就可以避开上下班时候的打卡拥堵，其次是整个统计管理方便简单，直接调用就可以；再次是几乎不存在各种机器故障的原因导致打卡失败，因此对于公司的内勤打卡而言，办公软件的选择几乎是最优的选择；但是对于外勤的管理，似乎传统的考勤模式就没有更好的解决方案了，但是移动办公软件的出现，很轻松的为这个方面打开了口子，因为基于移动地理位置的定位，几乎就可以很轻松的将外勤管理一站式解决，但是很多人可能会认为，互联网用技术解决了传统的考勤管理的问题，那么成本必然会提高？
随着企业的快速发展，相应的各种信息也日益增长，原始的人工考勤已满足不了企业的需求，在此情况下，企业不约而同的引入考勤管理软件，也使考勤管理系统的开发得到很大的发展。而目前仍有很多企业的这项工作还处于传统手工纸质阶段，信息资源的数字化程度低，大部分历史积累的数据，尚未数字化。不利于科学管理和决策。
传统企业考勤管理都是以企业前台纸质打卡机或签到为主，记录员工出勤情况，每周根据出勤表及登记表对员工平时出勤情况奖惩，然后把数据上交到企业负责人。传统的员工请假方式需要经过多人的同意，请假困难也是员工的烦恼之一。这种的模式在目前企业管理中暴露出了许多弊端：一是员工请假不方便；二是员工请假对主管人员不透明，造成对员工出勤误记的情况；三是员工出勤表对分管经理、总经理不透明，分管经理、总经理很难知道企业的出勤情况，不便于与员工及时有效的沟通；四是员工对自己整个工作周的出勤情况没有整体的统计信息。
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