现在很多企业在面临纸质化问题带来的影响之后，逐渐开始推进信息化管理的进程，虽然人力资源管理系统前期需要投入一定成本，但其能为企业带来显著的效益。例如，无论是薪酬计算还是社保核算这些涉及大量数据的工作，若采用人工手动操作，稍不注意就容易出错，人力资源管理系统可以实现精准的统计和计算，可以避免人为错误的出现。

人力资源管理系统可以储存全公司的人力资源信息，信息保存集中并且完整不易丢失，需要使用的时候，可及时在线查询导出。而且所有流程申请、流程审核都可以通过人力资源管理系统运行，流程的的申请、办理完全移动化，可随时随地发起流程，办理流程。

企业管理者做的每一项决策都对企业发展产生影响，在缺乏精准数据的情况下，很多企业管理者都是根据经验进行决策，而人力资源管理系统是有着强大的数据分析功能，能够生成各种统计报表，为提供企业人力资源多方面的数据分析，同时，人力资源管理系统也为管理层进行战略目标和策略的实施提供了量化依据，帮助管理者做出正确的战略决策。

很多企业管理混乱并不是因为缺乏管理制度，而是管理制度无法有效落实，很多管理事务容易受到管理人员的人为干预，通过人情关系进行选择性管理。应用人力资源管理系统后，所有日常事务工作都由系统规范化处理，人力资源管理系统的实施避免了人工干预，减少不公平的情况，提升管理透明度。